Secesní římskokatolický kostel byl postaven v letech 1904 až 1905 nákladem Spolku sv. Bonifáce podle stavebních plánů Matěje Blechy, stavitele v Karlíně. Autorství chrámu je v odborné literatuře připisováno Emilu Králíčkovi. S přípravnými pracemi se započalo 3. října 1904. Krátce před velikonočními svátky roku 1905 byla stavba v hlavních věcech ukončena a 8. dubna 1905 byla za účasti libeňského faráře P. Václava Stejskala kolaudována, a to jako provizorium do r. 1910, protože podle návrhu regulace Libně byla na části pozemku projektována ulice. Následující den byl kostel vysvěcen světícím biskupem Františkem Kráslem, podle odhadu se slavnosti účastnilo na 10 tisíc lidí.